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德國派25 艘潛艇到海峽區域去攻擊登陸艦艇。但到6 月底，只有4 艘到達了巡邏區。其餘的21 艘中，有5 艘被迫返回基地，3 艘在巡邏中受傷，不得不返航。7 艘被擊沉。其餘6 艘還在設法通過強大的反潛巡邏。德國使用通氣管潛艇後，岸防航空兵反潛巡邏的能力迅速減弱，3 厘米波雷達一般探測不到潛艇通氣管的頭部，除非環境有利。
空中巡邏不得不依靠目視觀察去發現通氣管的小小頭部或它噴出的一團團煙霧。由於發現潛艇的準確性差，因此錯過不少機會，也有許多次警報報錯了。德潛艇幾乎都是被水面艦艇擊沉的，而且往往是在潛艇企圖攻擊護航艦艇並遭到連續的長時間的跟蹤之後被擊沉的。長時間跟蹤是由於發現潛艇很困難。大多數護航艦艇都習慣於大西洋的深水區作戰，很多戰時訓練的有經驗的聲納員還從來沒遇到用聲納在淺水區進行探測的機會。
在探測通氣管潛艇方面存在的問題使海軍部十分憂慮，它還擔心高速的（25 節）XXI 和XXIII 型潛艇很可能馬上服役。為了對付這種新潛艇，即使能設計出一種較快速的護衛艦，但還存在著聲納不能在20 節以上的航速使用的問題。這些高航速的通氣管潛艇，完全能以其機動性挫敗同盟國的高效力的反潛部隊。
在戰術上可能採取的唯一反措施是用4 艘護衛艦與1 艘德潛艇保持接觸，但是航速高時必然容易發生碰撞。德潛艇只要把速度降到15 節，就能發射音響自導魚雷，然後在混亂中高速逃脫。在戰略轟炸方針失敗後，解決阻止潛艇生產的長遠辦法是奪取造船廠和工廠。幸好，同盟國在德國高速潛艇開始大量服役之前做到了這一點。（到戰爭結束時止，XXI 型潛艇有136 艘已下水，83 艘開始建造；XXIII 型潛艇有63 艘已下水，26 艘正在建造）。
由於同盟國在歐洲登陸的威脅，德國人設計並建造了袖珍潛艇，以對付登陸艦艇。當同盟國軍隊向歐洲海岸移動時。這些袖珍潛艇立即從荷蘭的基地出發去攻擊英國東海岸附近和英吉利海峽的艦艇1945 年3 月11 日，在反德國E 型艇的巡邏中，“托林頓”號護衛艦在30 海里處得到一個雷達接觸信號，這個信號好象是浮標。之後信號消失了，“托林頓”號駛往該位置，投擲了3 組共約30 顆深水炸彈，定深在50 至100 英尺之間。在第3 組深水炸彈的爆炸聲靜下來之後，一艘袖珍潛艇在左舷尾後浮出水面，“托林頓”號向其開火，2 名艇員投降，潛艇沉沒。兩天後，“托林頓”號接到在古德溫沙洲以南1 海里處發現1 艘潛艇的報告，又擊沉了第2 艘袖珍潛艇。該艦在報告的位置上進行探測時，沒發現任何潛艇。作為一種預防措施，該艦發射了1 組深水炸彈，企圖把該區域內的潛艇嚇跑。當爆炸聲消失後，1 艘袖珍潛艇在爆炸中心浮出水面，在它沉沒之前，艇員們爭先恐後地離開了。袖珍潛艇非常小，在水面上幾乎看不見它，用雷達很難探測到，實際上，用聲納也不可能探測到。
從袖珍潛艇艇員那裡繳獲的一些文件中，海軍部得知袖珍潛艇已參加作戰。由於袖珍潛艇的攻擊日益頻繁，第16 大隊奉命進行專門的空中巡邏，以攔截該型潛艇。這些巡邏飛行主要是由第119 中隊的“大青花魚”式和“劍魚”式飛機進行。這些飛機飛行速慢，對付小型慢速目標是很理想的。到戰爭結束時，水面護航艦艇共擊沉50 艘袖珍潛艇，被飛機擊沉16 艘，另外還有10 艘可能也是飛機擊沉的。
為了使德潛艇忘卻大敗北的苦惱，鄧尼茨還在搜腸刮肚地想著：下一步該在哪個方面展開作戰呢？
然而無論是讓U 艇到哪個海域作戰，總有盟軍的護衛兵力那裡等待著。
每當想到U 艇返回基地時乘員總會減少，鄧尼茨心裡總會感到非常悲哀。
鄧尼茨一面把少數U 艇派遣到遙遠的海域，一面又把大部分的兵力配置到英本上比西的航路，以便展開來年的攻勢。
早在1944 年1 月中旬，在從北起費洛斯群島（蘇格蘭以西約400 公里），南到布勒斯特（布尼塔尼半島西端）一線上，部置了20 多隻U 艇。艇與艇之間保持50 公里的間隔進行警戒配置，除了充電之外，都保持著潛航方式。當然在這種情形下，發現盟軍艦隻的機會較少，因而把搜索敵方的任務交給了空軍。
空軍飛行員對海上作戰大都不熟悉，因此，雖然幾次發現了盟軍船隊，但由於不能進行巧妙的接觸，U 艇的攻擊也就宣告失敗了。
之後，U 艇的警戒線接近到了愛爾蘭沿岸。想不到這次命令早被英國海軍部偵獲破譯，以致一支強大的航空兵力很快集中到愛爾蘭基地。
1 月27 日，德國警戒飛機發現兩個船隊，但在向U 艇發出有關位置的電報時，卻被英軍所偵獲。28 日，飛出愛爾蘭基地的英軍飛機捕捉到了U 艇群。
在這場戰鬥中，德軍又損失了2 只U 艇。
鄧尼茨下令中止作戰，盟軍卻死盯著U 艇不放，在1 月31 日，又1 只U 艇被“咬死”。
U 艇雖然展開幾次小規模的拼死攻擊，但始終也沒有奪回已往失去的主動權，只是徒增損害而已。
2 月13 日，為了避免損失，鄧尼茨把U 艇轉移到遙遠的西方。至此，潛艇同令部已經喪失了戰機。到2 月下旬，U 艇的損失明顯地增加了，這時鄧尼茨也大感失望了。