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民國元年八月二十五日，宋教仁不顧一部分同盟會成員的反對，以“朝野合作，新舊合作”為號召，以同盟會為基幹，聯合國民公黨、國民共進會等小黨派，在北京整合成立了國民黨。
國民黨成立後，孫文被推選為理事長，但孫文聲稱要“專心致志於鐵路之建築”，遂辭去理事長一職，委託宋教仁代理。
剛剛成立的國民黨，立刻積極投入到第一屆國會選舉當中。為幫助國民黨爭取國會選舉的勝利，宋教仁於十月離京南下，在南方各地發表演講，抨擊時政，宣傳政見。他每到一處，均受到社會各界的熱烈歡迎，很快在南方颳起了一股凌厲的“宋教仁旋風”。國會選舉雖然還沒開始，但國民黨的呼聲已經非常之高。
在國民黨有望選舉勝利並組織責任內閣的情況下，孫文卻沒有與宋教仁就選舉的相關事宜進行磋商，反而在選舉前一個月赴日本進行並不急切的考察訪問。
此時宋教仁已經抵達上海，寄住在黃興家中。他在國民黨上海交通部發表演講，明確地撇開孫文的五權憲法，大講自己的三權分立憲政設想，然後以激烈的言辭，全盤否定了袁世凱政府當局的內政外交，認為只有國民黨方面出面組織責任內閣，才能解決當前的種種問題。
民國二年三月間，在北京舉行的中華民國第一屆國會選舉結束，國民黨以壓倒性優勢獲勝，在參議院與眾議院皆獲得最多席次，成為國會最大黨。
第一屆正式國會定於四月在北京開幕，宋教仁躊躇滿志，準備以國民黨黨首的身份籌劃組織第一屆責任內閣。與此同時，袁世凱亦多次催促宋教仁“赴京會商要政”。宋教仁於是決定出發北上，並選擇了三月二十日作為他離開上海的日子。
在宋教仁臨行之前，他接連收到“友人密函”，說他之前在南京之時，已經有人“潛隨其後，希圖行刺”，勸他暫時不要北上，平時也要多加防範。宋教仁卻不以為然，認為這只是坊間的謠言，沒有放在心上。
三月二十日晚十點多鐘，宋教仁在黃興、廖仲愷、于右任等人的陪同下，來到上海火車站，準備乘坐特別快車前往南京，轉而北上。
火車出發是在十一點鐘，時間尚早，宋教仁、黃興等人便在議員接待室里休息。
宋教仁與眾友人議論時政，聊談甚歡，根本沒注意到此時的接待室外，有人正頻頻向內窺探。
十點四十分，離發車時間只剩下二十分鐘了，檢票處開始檢票。
宋教仁等人離開接待室，有說有笑地來到檢票處，排隊等待檢票。
就在這時，幾步開外突然響起了一聲沉悶的槍聲！
黃興、廖仲愷等人急忙驚惶四顧，卻見宋教仁靠在旁邊的鐵椅上，用手捂住腹部，對近旁的于右任痛苦地說道：“我中槍了……”
黃興等人還沒回過神來，又聽見了兩聲槍響，幸而無人被擊中，其中一顆子彈，堪堪貼著黃興的身邊掠過。
黃興急忙向槍響處望去，只見一個身形甚短、身穿黑色常服的人，不顧一切地撥開人群，躍過車站鐵欄，向東面逃竄，頃刻間沒了身影。
宋教仁被子彈擊中了腹部，那是要害部位，臉色剎那間一片蒼白。
于右任急忙衝出車站，找來一輛汽車，將宋教仁送往附近的滬寧鐵路醫院。但由於是深夜十一點鐘，醫生不在醫院，只好又急忙找人去通知醫生。
此時的宋教仁，神志還算清醒。他腹部疼痛，無法大聲說話，只能讓于右任把頭挨近他胸前，然後喘息著說道：“我痛得很，恐怕是活不下去了。如果我死了，就把我所有存書捐入南京圖書館……我老母尚在，唯有請諸位替我照料了……”
十幾分鐘後，醫生聞訊趕來，查看了宋教仁的傷情，認為傷在腹部，且傷勢嚴重，必須立即進行手術，才有一線活命的希望。
此時已是凌晨，手術立刻進行。醫生通過腹部手術，很快取出了子彈。子彈是從側後方穿過腰際射入腹部的，傷及了小腹及大腸，所以醫生又主刀進行了腸道縫補手術。
手術結束後，宋教仁的情況不見好轉，反而不斷地惡化。
宋教仁自知難逃一死，於是授意黃興代擬電報發給袁世凱：“北京袁大總統鑒：仁本夜乘滬寧車赴京，敬謁鈞座。十時四十五分在車站突被奸人自背後施槍，彈由腰上部入腹下部，勢必至死。竊思仁自受教以來，即束身自愛，雖寡過之未獲，從未結怨於私人。清政不良，起任改革，亦重人道、守公理，不敢有毫權之見存。今國基未固，民福不增，遽爾撒手，死有餘恨。伏冀大總統開誠心，布公道，竭力保障民權，俾國家得確定不拔之憲法，則雖死之日，猶生之年。臨死哀言，尚祈見納。宋教仁。哿。”他又叮囑守在病榻前的諸位革命友人勿以他為念，要奮力國事，然後感嘆道：“我為調和南北事費盡心力，造謠者及一般民眾不知原委，每多誤解，我受此痛苦也是應當，死亦何悔？只可惜兇手在逃，終不知誤會吾者為何許人。罷了，罷了……”
二十二日凌晨四點，宋教仁的傷勢急劇惡化。他雙手發冷，目睛仰翻，已經不能言語，只能以黯淡的目光環顧四周，眼神里充滿了不舍之情。
國民黨成立後，孫文被推選為理事長，但孫文聲稱要“專心致志於鐵路之建築”，遂辭去理事長一職，委託宋教仁代理。
剛剛成立的國民黨，立刻積極投入到第一屆國會選舉當中。為幫助國民黨爭取國會選舉的勝利，宋教仁於十月離京南下，在南方各地發表演講，抨擊時政，宣傳政見。他每到一處，均受到社會各界的熱烈歡迎，很快在南方颳起了一股凌厲的“宋教仁旋風”。國會選舉雖然還沒開始，但國民黨的呼聲已經非常之高。
在國民黨有望選舉勝利並組織責任內閣的情況下，孫文卻沒有與宋教仁就選舉的相關事宜進行磋商，反而在選舉前一個月赴日本進行並不急切的考察訪問。
此時宋教仁已經抵達上海，寄住在黃興家中。他在國民黨上海交通部發表演講，明確地撇開孫文的五權憲法，大講自己的三權分立憲政設想，然後以激烈的言辭，全盤否定了袁世凱政府當局的內政外交，認為只有國民黨方面出面組織責任內閣，才能解決當前的種種問題。
民國二年三月間，在北京舉行的中華民國第一屆國會選舉結束，國民黨以壓倒性優勢獲勝，在參議院與眾議院皆獲得最多席次，成為國會最大黨。
第一屆正式國會定於四月在北京開幕，宋教仁躊躇滿志，準備以國民黨黨首的身份籌劃組織第一屆責任內閣。與此同時，袁世凱亦多次催促宋教仁“赴京會商要政”。宋教仁於是決定出發北上，並選擇了三月二十日作為他離開上海的日子。
在宋教仁臨行之前，他接連收到“友人密函”，說他之前在南京之時，已經有人“潛隨其後，希圖行刺”，勸他暫時不要北上，平時也要多加防範。宋教仁卻不以為然，認為這只是坊間的謠言，沒有放在心上。
三月二十日晚十點多鐘，宋教仁在黃興、廖仲愷、于右任等人的陪同下，來到上海火車站，準備乘坐特別快車前往南京，轉而北上。
火車出發是在十一點鐘，時間尚早，宋教仁、黃興等人便在議員接待室里休息。
宋教仁與眾友人議論時政，聊談甚歡，根本沒注意到此時的接待室外，有人正頻頻向內窺探。
十點四十分，離發車時間只剩下二十分鐘了，檢票處開始檢票。
宋教仁等人離開接待室，有說有笑地來到檢票處，排隊等待檢票。
就在這時，幾步開外突然響起了一聲沉悶的槍聲！
黃興、廖仲愷等人急忙驚惶四顧，卻見宋教仁靠在旁邊的鐵椅上，用手捂住腹部，對近旁的于右任痛苦地說道：“我中槍了……”
黃興等人還沒回過神來，又聽見了兩聲槍響，幸而無人被擊中，其中一顆子彈，堪堪貼著黃興的身邊掠過。
黃興急忙向槍響處望去，只見一個身形甚短、身穿黑色常服的人，不顧一切地撥開人群，躍過車站鐵欄，向東面逃竄，頃刻間沒了身影。
宋教仁被子彈擊中了腹部，那是要害部位，臉色剎那間一片蒼白。
于右任急忙衝出車站，找來一輛汽車，將宋教仁送往附近的滬寧鐵路醫院。但由於是深夜十一點鐘，醫生不在醫院，只好又急忙找人去通知醫生。
此時的宋教仁，神志還算清醒。他腹部疼痛，無法大聲說話，只能讓于右任把頭挨近他胸前，然後喘息著說道：“我痛得很，恐怕是活不下去了。如果我死了，就把我所有存書捐入南京圖書館……我老母尚在，唯有請諸位替我照料了……”
十幾分鐘後，醫生聞訊趕來，查看了宋教仁的傷情，認為傷在腹部，且傷勢嚴重，必須立即進行手術，才有一線活命的希望。
此時已是凌晨，手術立刻進行。醫生通過腹部手術，很快取出了子彈。子彈是從側後方穿過腰際射入腹部的，傷及了小腹及大腸，所以醫生又主刀進行了腸道縫補手術。
手術結束後，宋教仁的情況不見好轉，反而不斷地惡化。
宋教仁自知難逃一死，於是授意黃興代擬電報發給袁世凱：“北京袁大總統鑒：仁本夜乘滬寧車赴京，敬謁鈞座。十時四十五分在車站突被奸人自背後施槍，彈由腰上部入腹下部，勢必至死。竊思仁自受教以來，即束身自愛，雖寡過之未獲，從未結怨於私人。清政不良，起任改革，亦重人道、守公理，不敢有毫權之見存。今國基未固，民福不增，遽爾撒手，死有餘恨。伏冀大總統開誠心，布公道，竭力保障民權，俾國家得確定不拔之憲法，則雖死之日，猶生之年。臨死哀言，尚祈見納。宋教仁。哿。”他又叮囑守在病榻前的諸位革命友人勿以他為念，要奮力國事，然後感嘆道：“我為調和南北事費盡心力，造謠者及一般民眾不知原委，每多誤解，我受此痛苦也是應當，死亦何悔？只可惜兇手在逃，終不知誤會吾者為何許人。罷了，罷了……”
二十二日凌晨四點，宋教仁的傷勢急劇惡化。他雙手發冷，目睛仰翻，已經不能言語，只能以黯淡的目光環顧四周，眼神里充滿了不舍之情。