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12月12日，已宣布獨立的14個省、39位代表先後到達南京，選出浙江代表湯爾和為議長，廣東代表王寵惠為副議長；並議定12月16日選舉臨時大總統。
12月15日，本來就錯綜複雜的局勢又有了變化——從湖北趕到的浙江代表陳毅轉達黎元洪的意見，要求暫緩選舉總統。因為此時黎元洪已與前清重臣袁世凱派到武漢的和談代表唐紹儀有所接洽，黎元洪認為大總統一席應虛位以待。經過一番反覆，各省代表重選黎元洪為大元帥，黃興為副元帥，但黎元洪又不能來南京，由黃興代行大元帥職位。
從上面可以看出，選舉袁世凱為大總統的問題，這時已公開提到檯面上來了。
黎元洪、湯化龍其實早就與袁世凱有聯繫。袁世凱曾接連3次致信黎元洪，讓其“和平了結，不獨不究既往，尚可定必重用，相助辦理朝政”，而黎則“望袁如帝天”，一意主和，並致信袁世凱，希望他能倒戈讓清帝遜位。這種想法應該也不僅僅只是黎元洪才有——1911年11月9日，黃興在給袁世凱的信中，一面譴責袁部火燒漢口，又謂“人才原有高下之分，起義斷無先後之別”，以拿破崙、華盛頓相期許，敦促袁世凱反正。
在當時的革命黨人當中，很多人都對袁世凱寄予期望。11月18日，在上海的各省代表與宋教仁等，都傾向於“以大總統餌袁世凱而推翻清室”。整個上海包括革命黨人都籠罩在妥協、擁袁的氣氛中，當時已經形成這樣一種心理：只要袁贊成共和，迫使清帝退位，就選他為大總統。
革命黨人方面，由於原來同盟會內部的分歧和分裂，始終未能得到整合的機會，加之組織紀律鬆弛、渙散，亦很難有主導局面的統一意見。當武裝推翻清政府的短期目標實現後，內部的分裂與不和再一次爆發出來。
而孫中山就在這個時刻回來了，等待他的，將會是一種什麼樣的局面？
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就任臨時大總統
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1911年12月21日，孫中山抵達香港，胡漢民、廖仲愷乘兵艦到香港迎接；4天後，在胡漢民、宮崎寅藏、池亨吉、荷馬里等人的陪同下，孫中山到達上海。
這天清晨，雖然下著濛濛細雨，但上海十六鋪金利源碼頭上，布滿了滬軍都督府的衛隊和軍警，擠滿了各國領事，中外記者和各機關團體的代表。馬路邊，碼頭上到處飄揚著各式各樣的旗幟。黃興、宋教仁和滬軍都督陳其美走上船。他們背後，站立著成千上萬的歡迎人群。
上午9點3刻，當穿著一套黑色西服的孫中山出現在海輪船舷旁時，歡迎的人群又一次轟動了。孫中山也高舉著帽子，向久違的祖國人民致意。上海同盟會的同志們還為孫中山鳴放禮炮21響，以表示對他的敬意。這也是孫中山經過15年的國外流亡生活之後，第一次公開回到故土。黃興、陳其美簇擁著孫中山，在歡呼聲中登上碼頭。
12月26日，黃興、陳其美等出面，邀請在上海的同盟會員在愛麗園宴請孫中山；當晚，孫中山不顧旅途勞累，立即召開同盟會最高幹部會議，討論組織臨時政府問題。
討論時，宋教仁主張採取內閣制，陳述總統制的多種弊端；而孫中山則主張採取總統制，不設總理。會議爭論很長時間也沒有定論。最後張靜江表態說：“好！除了孫先生，沒有第二人能說這樣的話的了。我們惟有遵照孫先生的意見行事。”黃興也說：“我贊成孫先生的意見。”
12月29日上午，南京17省代表會議正式選舉中華民國臨時大總統。選舉前，浙江代表、大會主席湯爾和致詞，他說這次選舉是“中國4000年來歷史別開生面”，代表們對此都報以熱烈掌聲。
投票結果，孫中山得16票，黃興得1票。孫中山以超過投票總數2/3的票數，眾望所歸，當選為中華民國第一任臨時大總統。當選舉結果公布時，“眾呼中華共和萬歲3聲，是時音樂大作，在場軍學各界互相祝賀，喜悅之情，達於極點”。
對很多代表來說，直到選舉前兩天才是他們第一次見到傳聞已久的孫中山本人。12月27日，孫中山接見各省代表，一位代表事後回憶說：當時感到驚異的是先生的語氣真摯亢爽，直截了當，有當仁不讓、捨我其誰之慨，一洗中國縉紳虛偽謙遜、矯揉造作之態，雖細微處，亦見偉大。可見，孫中山的個人魅力一舉征服了那些革命者。
偉大的革命鬥爭造就了孫中山。這位中國近代史上最有威望、最有影響、最有經驗的人物當選為中國第一任臨時大總統，完全符合中國人民的意願。代表會議立即做出決議：各省代表具簽名書，交正、副議長到滬歡迎臨時大總統來寧。
孫中山當選臨時大總統的消息一經傳出，全國人民和海外僑胞興高采烈，一片歡騰。“自總統選舉以來，南洋、澳、歐美各地賀電為日盈尺”。
12月31日，參議院決議1912年1月1日為中華民國元年正月一日，臨時大總統孫中山來南京就職。孫中山赴南京就職前，唯恐鋪張浪費，特別囑咐滬軍都督陳其美：“我們革命黨，全不採儀式，只一車足矣。”
1912年1月1日上午11時，孫中山乘滬寧鐵路專用花車起行。到站歡送者有各團體代表及軍隊等數千人，專軍在禮炮聲響後徐徐啟動。途經蘇州、無錫、常州、鎮江等站時，均有數千至上萬群眾列隊致敬，鼓樂齊鳴，歡聲雷動，“共和萬歲”、“總統萬歲”的呼聲響徹雲宵。
12月15日，本來就錯綜複雜的局勢又有了變化——從湖北趕到的浙江代表陳毅轉達黎元洪的意見，要求暫緩選舉總統。因為此時黎元洪已與前清重臣袁世凱派到武漢的和談代表唐紹儀有所接洽，黎元洪認為大總統一席應虛位以待。經過一番反覆，各省代表重選黎元洪為大元帥，黃興為副元帥，但黎元洪又不能來南京，由黃興代行大元帥職位。
從上面可以看出，選舉袁世凱為大總統的問題，這時已公開提到檯面上來了。
黎元洪、湯化龍其實早就與袁世凱有聯繫。袁世凱曾接連3次致信黎元洪，讓其“和平了結，不獨不究既往，尚可定必重用，相助辦理朝政”，而黎則“望袁如帝天”，一意主和，並致信袁世凱，希望他能倒戈讓清帝遜位。這種想法應該也不僅僅只是黎元洪才有——1911年11月9日，黃興在給袁世凱的信中，一面譴責袁部火燒漢口，又謂“人才原有高下之分，起義斷無先後之別”，以拿破崙、華盛頓相期許，敦促袁世凱反正。
在當時的革命黨人當中，很多人都對袁世凱寄予期望。11月18日，在上海的各省代表與宋教仁等，都傾向於“以大總統餌袁世凱而推翻清室”。整個上海包括革命黨人都籠罩在妥協、擁袁的氣氛中，當時已經形成這樣一種心理：只要袁贊成共和，迫使清帝退位，就選他為大總統。
革命黨人方面，由於原來同盟會內部的分歧和分裂，始終未能得到整合的機會，加之組織紀律鬆弛、渙散，亦很難有主導局面的統一意見。當武裝推翻清政府的短期目標實現後，內部的分裂與不和再一次爆發出來。
而孫中山就在這個時刻回來了，等待他的，將會是一種什麼樣的局面？
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就任臨時大總統
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1911年12月21日，孫中山抵達香港，胡漢民、廖仲愷乘兵艦到香港迎接；4天後，在胡漢民、宮崎寅藏、池亨吉、荷馬里等人的陪同下，孫中山到達上海。
這天清晨，雖然下著濛濛細雨，但上海十六鋪金利源碼頭上，布滿了滬軍都督府的衛隊和軍警，擠滿了各國領事，中外記者和各機關團體的代表。馬路邊，碼頭上到處飄揚著各式各樣的旗幟。黃興、宋教仁和滬軍都督陳其美走上船。他們背後，站立著成千上萬的歡迎人群。
上午9點3刻，當穿著一套黑色西服的孫中山出現在海輪船舷旁時，歡迎的人群又一次轟動了。孫中山也高舉著帽子，向久違的祖國人民致意。上海同盟會的同志們還為孫中山鳴放禮炮21響，以表示對他的敬意。這也是孫中山經過15年的國外流亡生活之後，第一次公開回到故土。黃興、陳其美簇擁著孫中山，在歡呼聲中登上碼頭。
12月26日，黃興、陳其美等出面，邀請在上海的同盟會員在愛麗園宴請孫中山；當晚，孫中山不顧旅途勞累，立即召開同盟會最高幹部會議，討論組織臨時政府問題。
討論時，宋教仁主張採取內閣制，陳述總統制的多種弊端；而孫中山則主張採取總統制，不設總理。會議爭論很長時間也沒有定論。最後張靜江表態說：“好！除了孫先生，沒有第二人能說這樣的話的了。我們惟有遵照孫先生的意見行事。”黃興也說：“我贊成孫先生的意見。”
12月29日上午，南京17省代表會議正式選舉中華民國臨時大總統。選舉前，浙江代表、大會主席湯爾和致詞，他說這次選舉是“中國4000年來歷史別開生面”，代表們對此都報以熱烈掌聲。
投票結果，孫中山得16票，黃興得1票。孫中山以超過投票總數2/3的票數，眾望所歸，當選為中華民國第一任臨時大總統。當選舉結果公布時，“眾呼中華共和萬歲3聲，是時音樂大作，在場軍學各界互相祝賀，喜悅之情，達於極點”。
對很多代表來說，直到選舉前兩天才是他們第一次見到傳聞已久的孫中山本人。12月27日，孫中山接見各省代表，一位代表事後回憶說：當時感到驚異的是先生的語氣真摯亢爽，直截了當，有當仁不讓、捨我其誰之慨，一洗中國縉紳虛偽謙遜、矯揉造作之態，雖細微處，亦見偉大。可見，孫中山的個人魅力一舉征服了那些革命者。
偉大的革命鬥爭造就了孫中山。這位中國近代史上最有威望、最有影響、最有經驗的人物當選為中國第一任臨時大總統，完全符合中國人民的意願。代表會議立即做出決議：各省代表具簽名書，交正、副議長到滬歡迎臨時大總統來寧。
孫中山當選臨時大總統的消息一經傳出，全國人民和海外僑胞興高采烈，一片歡騰。“自總統選舉以來，南洋、澳、歐美各地賀電為日盈尺”。
12月31日，參議院決議1912年1月1日為中華民國元年正月一日，臨時大總統孫中山來南京就職。孫中山赴南京就職前，唯恐鋪張浪費，特別囑咐滬軍都督陳其美：“我們革命黨，全不採儀式，只一車足矣。”
1912年1月1日上午11時，孫中山乘滬寧鐵路專用花車起行。到站歡送者有各團體代表及軍隊等數千人，專軍在禮炮聲響後徐徐啟動。途經蘇州、無錫、常州、鎮江等站時，均有數千至上萬群眾列隊致敬，鼓樂齊鳴，歡聲雷動，“共和萬歲”、“總統萬歲”的呼聲響徹雲宵。