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由於“金瓶掣籤”的制度得到了象八世達賴喇嘛等西藏廣大僧俗的擁護和支持，很快就開始在西藏和其他藏區及蒙古地區實行。但是，從靈童轉世方向的確認，到觀看聖湖顯影等方面，護法神仍然起著重要的作用，這是執行“金瓶掣籤”制度過程中還存在的一個重要問題。但是，不管怎麼說，“金瓶掣籤”制度畢竟成了藏傳佛教活佛轉世制度中的一個致關重要的環節，儘管西藏歷史上，也有一些達賴或者班撣“轉世靈童”的認定，是免予掣籤的。但免與不免的決定權，仍在清朝中央，仍在清朝皇帝，到了民國時期，也依然如此，決定權仍在中央政府。
西藏歷史上，第一個被免予金瓶掣籤的是九世達賴喇嘛；第一個經金瓶掣籤認定的是十世達賴喇嘛。
1804 年8 月18 日，曾親自在大昭寺迎接金奔巴瓶的八世達賴喇嘛在布達拉宮圓寂，而他的轉世靈童也將首次用金瓶來決定。但是，七世班禪、攝政濟隆呼圖克圖、三大寺代表、全體噶倫等領銜，請駐藏大臣玉寧寫了一道奏摺轉呈嘉慶皇帝。內容是鄧柯靈童，確係第八世達賴喇嘛的轉世，請求免予“金瓶掣籤”。駐藏大臣也向嘉慶帝奏稱，經過種種核驗，實系第八世達賴喇嘛復出無疑，請求“俯允所請，免其入瓶掣定”。嘉慶帝批准了這一請求。但是，為了不讓西藏和其他藏區以此為例，事後，他又下了一道諭旨說：
“從前指稱呼畢勒罕出世，率多牽強附會，或僅小著靈驗，不足憑信。仰蒙高宗純皇帝特賞金奔巴瓶，飭令書名封貯，誦經簽掣，以防弊混。今達賴喇嘛甫逾二歲，異常聰慧，早悟前生，似此信而有證，洵為從來所未有。設當高宗純皇帝時，亦必立沛恩施，無須復令貯瓶簽掣。但此系僅見之事，且徵驗確鑿，毫無疑義，嗣後自應仍照舊章，不得援以為例”。
嘉慶帝的意思很清楚，金瓶掣籤是先帝所立，這個規章是不能違背的，否則各地都如法炮製，請求免予掣籤，這項重大的活佛制度改革就會遇到困難。果然，九世達賴喇嘛圓寂後，類似的情況又發生了。
1815 年2 月11 日，年僅11 歲的九世達賴喇嘛隆朵嘉措突然在布達拉宮暴亡。嘉慶帝下令一面尋訪轉世靈童，一面由掌辦商上事務的第穆呼圖克圖任攝政。對九世達賴喇嘛的去逝，嘉慶感到非常意外和懊悔。當時因為駐藏大臣奏稱九世達賴喇嘛經過種種“徵驗”，確為第八世達賴“轉世”，嘉慶帝才免予掣籤的，可是“如果所稱徵驗，俱屬確實，自應長久住世，宣揚黃教，何以不能永年？可見前次玉寧所奏，多有不實，朕一時輕信，至今猶以為悔”。由於西藏在十世達賴喇嘛轉世的問題上又請“免予掣籤”，嘉慶帝立刻諭示駐藏大臣玉寧、珂實克二人“不先加駁回，實屬錯誤，均著傳旨申飭”。指示十世達賴喇嘛轉世靈童的認定必須經過“金瓶掣籤”的手續，才能認定。
據藏文史料記載，噶廈和三大寺的代表在今天的四川藏區找到了三個“靈童”。這時嘉慶皇帝已經去逝，道光皇帝繼位。這位皇帝比起嘉慶帝來，更加堅定地執行了乾隆皇帝制定的金瓶掣籤制度，他於1821 年，諭示軍機大臣說：
“..前據玉寧等奏里塘幼孩有靈異之跡。今察木多所屬復出有幼孩二人，均有吉祥佳兆。前後共得三名，令其親丁師傅等攜至前藏，文乾等會同噶勒丹錫呼圖薩瑪第巴克什等確加試驗。如均有靈異之性，即照例寫簽入瓶，對眾諷經掣定，核實奏聞。若試驗未確，仍令另行訪查，俟靈異幼孩數足三人再行照例辦理可也。將此諭令知之”。
1822 年1 月15 日，根據道光皇帝的命令，七世班禪專程從札什倫布寺趕到拉薩主持十世達賴喇嘛轉世靈童的“金瓶掣籤”儀式。掣籤儀式在布達拉宮的皇帝牌位前舉行。此前，三名“靈重”都住在聶塘寺，駐藏大臣文干和幫辦大臣保昌與七世班禪共同決定，由攝政、七世班禪、駐藏大臣等親赴聶塘寺，將三名“靈童”帶到布達拉宮。掣籤儀式由駐藏大臣文干和幫辦大臣保昌親自主持。結果抽出西康理塘生的小孩為十世達賴喇嘛，他就是西藏第一位通過金瓶掣籤認定的達賴喇嘛楚臣嘉措。此外，經金瓶掣籤認定的還有十一世和十二世達賴喇嘛。
金瓶掣籤儀式是如何進行的呢？
一般情況下，駐藏大臣、幫辦大臣、達賴喇嘛或班禪、攝政等進門後，先要按職位或者是傳統的習慣依次入座，隨後是近侍獻清茶和酥油茶。當這項傳統的禮節結束後，開始當眾核對入掣象牙籤上用滿文、蒙文和藏文寫的“靈童”的名字、生年，然後送給達賴喇嘛或班禪復看後，又讓每位“靈童”的家人跪看牙籤的名字、年歲有無錯誤。當一切都準確無誤後，用黃紙包好，供在瓶前。這時，喇嘛們開始念經，等誦經儀式結束後，幫辦大臣來到金瓶前，跪下叩首三次，然後，用雙手將象牙籤舉過頭頂放入金瓶內，再用手旋轉兩圈，蓋好金瓶蓋，起立重新回到自己的位置。這時，喇嘛們又開始念經。念經儀式結束後，駐藏大臣走到金瓶前，也跪下叩首三次，然後跪著打開金瓶蓋，用手旋轉多次，掣出象牙籤一支。此時在左邊恃立的幫辦大臣，打開黃紙，當眾宣看。被認定為轉世靈童的家庭人員在跪聽掣籤結果後，一般還要觀看象牙籤，然後再送給達賴喇嘛或班禪審看，再將簽供在金瓶前。剩下的沒有掣中的象牙籤此時也要從瓶中抽出，給在坐的官員和高僧觀看，最後這些“靈童”的家庭成員也要被召進觀看，除去疑義，並用紙擦去。金瓶掣籤儀式就此全部結束。
西藏歷史上，第一個被免予金瓶掣籤的是九世達賴喇嘛；第一個經金瓶掣籤認定的是十世達賴喇嘛。
1804 年8 月18 日，曾親自在大昭寺迎接金奔巴瓶的八世達賴喇嘛在布達拉宮圓寂，而他的轉世靈童也將首次用金瓶來決定。但是，七世班禪、攝政濟隆呼圖克圖、三大寺代表、全體噶倫等領銜，請駐藏大臣玉寧寫了一道奏摺轉呈嘉慶皇帝。內容是鄧柯靈童，確係第八世達賴喇嘛的轉世，請求免予“金瓶掣籤”。駐藏大臣也向嘉慶帝奏稱，經過種種核驗，實系第八世達賴喇嘛復出無疑，請求“俯允所請，免其入瓶掣定”。嘉慶帝批准了這一請求。但是，為了不讓西藏和其他藏區以此為例，事後，他又下了一道諭旨說：
“從前指稱呼畢勒罕出世，率多牽強附會，或僅小著靈驗，不足憑信。仰蒙高宗純皇帝特賞金奔巴瓶，飭令書名封貯，誦經簽掣，以防弊混。今達賴喇嘛甫逾二歲，異常聰慧，早悟前生，似此信而有證，洵為從來所未有。設當高宗純皇帝時，亦必立沛恩施，無須復令貯瓶簽掣。但此系僅見之事，且徵驗確鑿，毫無疑義，嗣後自應仍照舊章，不得援以為例”。
嘉慶帝的意思很清楚，金瓶掣籤是先帝所立，這個規章是不能違背的，否則各地都如法炮製，請求免予掣籤，這項重大的活佛制度改革就會遇到困難。果然，九世達賴喇嘛圓寂後，類似的情況又發生了。
1815 年2 月11 日，年僅11 歲的九世達賴喇嘛隆朵嘉措突然在布達拉宮暴亡。嘉慶帝下令一面尋訪轉世靈童，一面由掌辦商上事務的第穆呼圖克圖任攝政。對九世達賴喇嘛的去逝，嘉慶感到非常意外和懊悔。當時因為駐藏大臣奏稱九世達賴喇嘛經過種種“徵驗”，確為第八世達賴“轉世”，嘉慶帝才免予掣籤的，可是“如果所稱徵驗，俱屬確實，自應長久住世，宣揚黃教，何以不能永年？可見前次玉寧所奏，多有不實，朕一時輕信，至今猶以為悔”。由於西藏在十世達賴喇嘛轉世的問題上又請“免予掣籤”，嘉慶帝立刻諭示駐藏大臣玉寧、珂實克二人“不先加駁回，實屬錯誤，均著傳旨申飭”。指示十世達賴喇嘛轉世靈童的認定必須經過“金瓶掣籤”的手續，才能認定。
據藏文史料記載，噶廈和三大寺的代表在今天的四川藏區找到了三個“靈童”。這時嘉慶皇帝已經去逝，道光皇帝繼位。這位皇帝比起嘉慶帝來，更加堅定地執行了乾隆皇帝制定的金瓶掣籤制度，他於1821 年，諭示軍機大臣說：
“..前據玉寧等奏里塘幼孩有靈異之跡。今察木多所屬復出有幼孩二人，均有吉祥佳兆。前後共得三名，令其親丁師傅等攜至前藏，文乾等會同噶勒丹錫呼圖薩瑪第巴克什等確加試驗。如均有靈異之性，即照例寫簽入瓶，對眾諷經掣定，核實奏聞。若試驗未確，仍令另行訪查，俟靈異幼孩數足三人再行照例辦理可也。將此諭令知之”。
1822 年1 月15 日，根據道光皇帝的命令，七世班禪專程從札什倫布寺趕到拉薩主持十世達賴喇嘛轉世靈童的“金瓶掣籤”儀式。掣籤儀式在布達拉宮的皇帝牌位前舉行。此前，三名“靈重”都住在聶塘寺，駐藏大臣文干和幫辦大臣保昌與七世班禪共同決定，由攝政、七世班禪、駐藏大臣等親赴聶塘寺，將三名“靈童”帶到布達拉宮。掣籤儀式由駐藏大臣文干和幫辦大臣保昌親自主持。結果抽出西康理塘生的小孩為十世達賴喇嘛，他就是西藏第一位通過金瓶掣籤認定的達賴喇嘛楚臣嘉措。此外，經金瓶掣籤認定的還有十一世和十二世達賴喇嘛。
金瓶掣籤儀式是如何進行的呢？
一般情況下，駐藏大臣、幫辦大臣、達賴喇嘛或班禪、攝政等進門後，先要按職位或者是傳統的習慣依次入座，隨後是近侍獻清茶和酥油茶。當這項傳統的禮節結束後，開始當眾核對入掣象牙籤上用滿文、蒙文和藏文寫的“靈童”的名字、生年，然後送給達賴喇嘛或班禪復看後，又讓每位“靈童”的家人跪看牙籤的名字、年歲有無錯誤。當一切都準確無誤後，用黃紙包好，供在瓶前。這時，喇嘛們開始念經，等誦經儀式結束後，幫辦大臣來到金瓶前，跪下叩首三次，然後，用雙手將象牙籤舉過頭頂放入金瓶內，再用手旋轉兩圈，蓋好金瓶蓋，起立重新回到自己的位置。這時，喇嘛們又開始念經。念經儀式結束後，駐藏大臣走到金瓶前，也跪下叩首三次，然後跪著打開金瓶蓋，用手旋轉多次，掣出象牙籤一支。此時在左邊恃立的幫辦大臣，打開黃紙，當眾宣看。被認定為轉世靈童的家庭人員在跪聽掣籤結果後，一般還要觀看象牙籤，然後再送給達賴喇嘛或班禪審看，再將簽供在金瓶前。剩下的沒有掣中的象牙籤此時也要從瓶中抽出，給在坐的官員和高僧觀看，最後這些“靈童”的家庭成員也要被召進觀看，除去疑義，並用紙擦去。金瓶掣籤儀式就此全部結束。