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至於幕府軍事機密要務參贊府機關的第一任成員，經過土岐俊豐保舉，由天野長興接替真田幸村的關防印信，真田幸村從九州返回，入駐軍機，另外還有擔任過首相和財相，內廷學祭酒的竹中重門，擔任過地方大員，軍隊統帥，糧草督管的安東隆盛，其中文一武二，足以均衡一切緊急事務的處理方向，土岐俊豐故意不提自己的名字，這便是怕授人以柄，反正孟憲文不會忘了他的，果不其然，人選擬定三日後，孟憲文反覆思考，還是在詔書上多加了兩個名字，第一人，興慶王時代就擔當過右軍師，地方政務，礦物，農務，財務各方面的全才，自己的師父藤堂高虎，第二人，擔當過八省中三省各級別職務，中書掌印大臣，國之次相，自己最寵愛的新晉能臣，幕府軍事機密要務參贊府機關的建立者之一，土岐俊豐，擁有專事專斷權，可以直接指揮兩府八省，僅次於王爵之下，藤堂高虎和土岐俊豐終於達到了人臣的頂峰，同時平分了幕府軍政的最高權柄。
幕府軍事機密要務參贊府機關成立後，藤堂高虎，土岐俊豐，竹中重門，真田幸村，安東隆盛開始了緊鑼密鼓的工作，辭去日常職務之後，幕府歷史上罕見的出現了整個中書左府，只有一個坂崎直盛，以中書舍人兼督察正官，一個上杉定勝，以中書舍人兼治部正官，兩人每日照面，整個中書左府，冷冷清清，堂堂帝國文臣首領衙門，此時的功效只剩下一個，騰出更多的辦公地點，給其他六省搶占而已，其實調走五人入職軍機之後，文惠王孟憲文就立刻想補充中書的行政人員，但是掂量再三，都沒有合適的，既然沒有才能和威望都足以進入中書的人員，所以只好按下不表，藤堂高虎和土岐俊豐對文惠王的心理，還有群臣的斤兩摸的一清二楚，早料到精英被抽走之後，中書暫時將無人頂替，軍機雖然作為特別部門存在，可只要一步步操作，必將最終成為帝國的權力核心，吞併本屬於中書的榮耀，只不過，這需要時間而已。
在幕府軍事機密要務參贊府機關里，領頭的自然是藤堂高虎和土岐俊豐，兩人當初聯手，為的就是至高權柄，現在終於到手了，為了避免聯盟出現破裂，重蹈當初天草時秀的覆轍，所以二人都壓制了對獨裁的渴望，暗自做了約定，軍事上土岐俊豐支持藤堂高虎的決定，政務上藤堂高虎支持土岐俊豐的決定，外交上二人先行碰頭，如果意見不統一，則由五人共同擬票，誰也不可對結果表示異議。牢不可破的攻守同盟面前，才從地方調往中央，尚不敢隨便開口的真田幸村，洞若觀火，自為官以來就扶搖直上的竹中重門，阿倍秀明的親傳弟子，親身經歷無數次政治鬥爭，經驗豐富的安東隆盛，三人立刻明白了這所謂軍事機密要務參贊府究竟是怎麼回事，於是三人老老實實，跟著藤堂高虎和土岐俊豐的腳步，維護著兩人的權力。
1624年（太平六年）七月，幕府軍事機密要務參贊府機關在所有人都不看好，等著它出洋相的情況下，漂亮的解決了東西兩面的大問題，贏得了滿堂的喝彩，雖然多數是投其所好，看文惠王高興，跟著附和的，但還是毋庸置疑的奠定了軍機府的政治地位，打著皇帝智囊團的旗號，實際上成為了政務決策人的身份。先說西面，琉球國斬使沉船，為了當年的誓約，要保護島津氏子嗣到底，不惜和幕府為敵，軍機府做出應對，淺井井賴率海軍西日本海防務艦隊出發，封鎖琉球島和南方諸島之間的聯繫，在不動用陸軍，不涉及指揮人員才高官小，擾亂軍中官階的情況下，對琉球國完成了經濟封鎖，沒有了大明朝的米麵，南方諸島國的天然資源，甚至本國賴以生存的各類海貨，琉球國上下在一個月內就暴亂頻發，尚豐王當年作為島津氏的人質，在薩摩藩生活過一段時間，學的一身九州蠻子的執拗，如此情況下，還是要求全力抗日（我勒個去），結果被重臣軟禁，直到尚豐王同意交出島津氏島津家久後人，才被釋放。
淺井井賴在大洋上斬了島津氏殘餘十一人祭旗之後，包圍依舊不撤，要求尚豐王和屬下對斬使沉船作出解釋和賠償，不然日本國顏面無存，早先迫於薩摩藩的壓力，為了尋求幫助，其實已經成為大明朝屬國的琉球，無奈之下，只能上書大明朝廷求救，可惜三撥使者都被淺井井賴攔下，這位身體裡流淌著淺井長政血液的聰明人，對被俘使者禮遇有加，款待後分別送回琉球，本來尚豐王還期待淺井井賴能學他一樣，斬殺琉球使者，自己就可以宣稱扯平，如果再不撤圍，琉球國上下也不會怪責他，而是怪責日本人不守信用，那時候就可以一戰了，哪知道人家根本不和你動這種小家子氣，出手大方，款待後送還，明擺著告訴你，要的是你吐血傷本的賠償，1624年（太平六年）六月十八日，尚豐王下令，割讓琉球國北部的大島，鬼界，度姑，永良部，由論五島，賠償日本，淺井井賴這才滿意的收兵，未費一兵一卒，取得五處海港完備的海島，為日本國和整個東亞諸國的經濟往來提供了最為便利的中轉樞紐，文惠王接到奏報後大喜，加封淺井井賴為世子少師，同大司馬事，領中書掌印大臣，繼續擔任幕府海防總督察辦（海軍總司令），依然留在海上，軍機府這才鬆了口氣，照旨加封。
東面一方，費勁就多一些，畢竟阿伊努人的戰鬥力和人數並不是琉球能比的，他們茹毛飲血，穿越山林泥沼好似飛騰一般，雖然生產力低下，無文化底蘊，羞於和生人接觸，但是一旦拿起石矛，石斧，還有長弓來，這些人各個都是合格的戰士，所謂全民皆兵，估計就是這個意思，當年孟昭德征伐蝦夷，調動近衛軍精銳一萬五千人，欽點安東隆盛為前鋒大將，田中續繼輔佐，死傷了一千餘人，才拿下了蝦夷的西南部，設立札幌縣，可撤兵不到一個月，就被蠻族嚇得官員逃回東北，孟昭德命令斬首棄城官員後，深思熟慮，就並不在理會札幌了，連如此神武的興慶王都拿蝦夷沒辦法，更何況文惠王呢，所以慎重起見，軍機府在處理東北問題上，首先派出了治部省的官員，和欲南逃的部落接洽，同意他們搬遷，不過必須抽調三百精壯從軍，按照四比一的比例，從這一千多人中扣下人質，再派出兵部省的官員，和與這支部落有血海深仇的強大部族溝通，用幫助該部落鎮壓其他敵對勢力的條件，換取和南逃部落的冰釋前嫌。
幕府軍事機密要務參贊府機關成立後，藤堂高虎，土岐俊豐，竹中重門，真田幸村，安東隆盛開始了緊鑼密鼓的工作，辭去日常職務之後，幕府歷史上罕見的出現了整個中書左府，只有一個坂崎直盛，以中書舍人兼督察正官，一個上杉定勝，以中書舍人兼治部正官，兩人每日照面，整個中書左府，冷冷清清，堂堂帝國文臣首領衙門，此時的功效只剩下一個，騰出更多的辦公地點，給其他六省搶占而已，其實調走五人入職軍機之後，文惠王孟憲文就立刻想補充中書的行政人員，但是掂量再三，都沒有合適的，既然沒有才能和威望都足以進入中書的人員，所以只好按下不表，藤堂高虎和土岐俊豐對文惠王的心理，還有群臣的斤兩摸的一清二楚，早料到精英被抽走之後，中書暫時將無人頂替，軍機雖然作為特別部門存在，可只要一步步操作，必將最終成為帝國的權力核心，吞併本屬於中書的榮耀，只不過，這需要時間而已。
在幕府軍事機密要務參贊府機關里，領頭的自然是藤堂高虎和土岐俊豐，兩人當初聯手，為的就是至高權柄，現在終於到手了，為了避免聯盟出現破裂，重蹈當初天草時秀的覆轍，所以二人都壓制了對獨裁的渴望，暗自做了約定，軍事上土岐俊豐支持藤堂高虎的決定，政務上藤堂高虎支持土岐俊豐的決定，外交上二人先行碰頭，如果意見不統一，則由五人共同擬票，誰也不可對結果表示異議。牢不可破的攻守同盟面前，才從地方調往中央，尚不敢隨便開口的真田幸村，洞若觀火，自為官以來就扶搖直上的竹中重門，阿倍秀明的親傳弟子，親身經歷無數次政治鬥爭，經驗豐富的安東隆盛，三人立刻明白了這所謂軍事機密要務參贊府究竟是怎麼回事，於是三人老老實實，跟著藤堂高虎和土岐俊豐的腳步，維護著兩人的權力。
1624年（太平六年）七月，幕府軍事機密要務參贊府機關在所有人都不看好，等著它出洋相的情況下，漂亮的解決了東西兩面的大問題，贏得了滿堂的喝彩，雖然多數是投其所好，看文惠王高興，跟著附和的，但還是毋庸置疑的奠定了軍機府的政治地位，打著皇帝智囊團的旗號，實際上成為了政務決策人的身份。先說西面，琉球國斬使沉船，為了當年的誓約，要保護島津氏子嗣到底，不惜和幕府為敵，軍機府做出應對，淺井井賴率海軍西日本海防務艦隊出發，封鎖琉球島和南方諸島之間的聯繫，在不動用陸軍，不涉及指揮人員才高官小，擾亂軍中官階的情況下，對琉球國完成了經濟封鎖，沒有了大明朝的米麵，南方諸島國的天然資源，甚至本國賴以生存的各類海貨，琉球國上下在一個月內就暴亂頻發，尚豐王當年作為島津氏的人質，在薩摩藩生活過一段時間，學的一身九州蠻子的執拗，如此情況下，還是要求全力抗日（我勒個去），結果被重臣軟禁，直到尚豐王同意交出島津氏島津家久後人，才被釋放。
淺井井賴在大洋上斬了島津氏殘餘十一人祭旗之後，包圍依舊不撤，要求尚豐王和屬下對斬使沉船作出解釋和賠償，不然日本國顏面無存，早先迫於薩摩藩的壓力，為了尋求幫助，其實已經成為大明朝屬國的琉球，無奈之下，只能上書大明朝廷求救，可惜三撥使者都被淺井井賴攔下，這位身體裡流淌著淺井長政血液的聰明人，對被俘使者禮遇有加，款待後分別送回琉球，本來尚豐王還期待淺井井賴能學他一樣，斬殺琉球使者，自己就可以宣稱扯平，如果再不撤圍，琉球國上下也不會怪責他，而是怪責日本人不守信用，那時候就可以一戰了，哪知道人家根本不和你動這種小家子氣，出手大方，款待後送還，明擺著告訴你，要的是你吐血傷本的賠償，1624年（太平六年）六月十八日，尚豐王下令，割讓琉球國北部的大島，鬼界，度姑，永良部，由論五島，賠償日本，淺井井賴這才滿意的收兵，未費一兵一卒，取得五處海港完備的海島，為日本國和整個東亞諸國的經濟往來提供了最為便利的中轉樞紐，文惠王接到奏報後大喜，加封淺井井賴為世子少師，同大司馬事，領中書掌印大臣，繼續擔任幕府海防總督察辦（海軍總司令），依然留在海上，軍機府這才鬆了口氣，照旨加封。
東面一方，費勁就多一些，畢竟阿伊努人的戰鬥力和人數並不是琉球能比的，他們茹毛飲血，穿越山林泥沼好似飛騰一般，雖然生產力低下，無文化底蘊，羞於和生人接觸，但是一旦拿起石矛，石斧，還有長弓來，這些人各個都是合格的戰士，所謂全民皆兵，估計就是這個意思，當年孟昭德征伐蝦夷，調動近衛軍精銳一萬五千人，欽點安東隆盛為前鋒大將，田中續繼輔佐，死傷了一千餘人，才拿下了蝦夷的西南部，設立札幌縣，可撤兵不到一個月，就被蠻族嚇得官員逃回東北，孟昭德命令斬首棄城官員後，深思熟慮，就並不在理會札幌了，連如此神武的興慶王都拿蝦夷沒辦法，更何況文惠王呢，所以慎重起見，軍機府在處理東北問題上，首先派出了治部省的官員，和欲南逃的部落接洽，同意他們搬遷，不過必須抽調三百精壯從軍，按照四比一的比例，從這一千多人中扣下人質，再派出兵部省的官員，和與這支部落有血海深仇的強大部族溝通，用幫助該部落鎮壓其他敵對勢力的條件，換取和南逃部落的冰釋前嫌。