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徐霞客在《徐霞客遊記》中記載有建文帝在貴州白雲山修行時遺留的遺蹟：“有巨杉二株，爽立磴旁，大合三人抱;西一株為火傷其頂，乃建文君所手植也。再折而西半里，為白雲寺，則建文君所開山也;前後架閣兩重。有泉一坎，在後閣前楹下，是為‘跪勺泉’。下北通閣下石竅，不盈不涸，取者必伏而勺，故名曰‘跪’，乃神龍所供建文君者。中通龍潭，時有金鯉出沒雲。由閣西再北上半里，為流米洞。洞懸山頂危崖間，其門南向，深僅丈餘，後有石龕，可傍為榻。其右有小穴，為米所從出，流以供帝者，而今無矣。左有峽高迸，而上透明窗，中架橫板，猶雲建文帝所遺者，皆神其跡者所託也。洞前憑臨諸峰，翠浪千層，環擁回伏，遠近皆出足下。洞左構閣，祀建文帝遺像(閣名‘潛龍勝跡’，像昔在佛閣，今移置此)，乃巡方使胡平運所建，前瞰遙山，右翼米洞，而不掩洞門，其後即山之絕頂。”看來建文帝在遜國後，在貴州停留過是有可能的。
還有學者認為，建文帝曾遁匿於貴州安順平壩縣境內的高峰寺。安順是中原聯繫西南的重要通道，明代先後有幾十萬大軍來此軍屯，他們祖籍大多為南京郊區以及江浦、六合等地。同時此地還有諸多隱匿的有利條件：依山傍水，地形隱蔽，易守難攻，不易發現;語言便於溝通;生活便於適應。據《平壩縣誌》載：高峰寺懸壁處，有“西來面壁”石刻，相傳出自建文帝手筆。“西”可能是“璽”的諧音。玉璽是皇權的象徵，建文帝逃到哪裡，玉璽也會帶到哪裡。高峰寺內齋堂地下有一處藏身洞，洞底有一石碑，上刻銘文：“秀峰肇建文跡塵知空般若門。”另一石碑為萬曆時所刻，碑文說高峰寺建於洪武七年，開山僧為秀峰大師，他於永樂四年七月收留過建文帝。
安順當地崖壁上有塊高大的“紅崖天書”，長十米，高六米，是用奇特的鐵紅色顏料寫成的文字，似篆非篆，無人能識。據報載最近終於有人破譯了“天書”：其成書約在1406年(明永樂四年)，是遜國的建文皇帝頒發的討伐燕王朱棣篡位的《伐燕詔檄》。全文直譯為：“燕反之心，迫朕遜國。叛逆殘忍，金川門破。殺戮屍橫，罄竹難書。大明日月無光，成囚殺之地。須降伏燕魔，作階下囚。丙戌(1406年)。甲天下之鳳凰(御製)。”這與《明史紀事本末》中所載朱允炆的一首詩相印證：“風塵一夕忽南侵，天命潛移四海心。鳳返丹山紅日遠，龍歸滄海碧雲深。紫微有象星還拱，玉漏無聲水自沉。遙想禁城今夜月，六宮猶望翠華臨。”如果譯文準確無誤，就能證實建文皇帝朱允炆確已逃出，並圖謀恢復。
四川也留下了建文帝的足跡，青川華嚴庵曾為建文帝的避難所。華嚴庵位於青川縣青溪鎮以南七公里的蓮花山上，占地面積超過一百畝，東西兩面是草木叢生的山溝，西側山溝內有巨石壘砌的雙層中空明代石牆，留下了石碑、石佛、九五方圓塔、清皇曆書等遺址、遺物。在“廣佛碑”和“華嚴庵重建碑”兩碑文上，兩者所記載的“建文帝於宣德六年到此”，與《明史紀事本末》中“宣德六年文帝由延安到西安入蜀”的記載相吻合。
還有人認為建文帝在四川平昌佛羅寺躲藏過，並病逝於此，葬於寺後山坡上。建文帝之所以選擇佛羅寺，是喜歡這裡偏僻難尋，不容易被發現。因他常常面向京城的方向暗自哭泣，後人就把佛羅寺改稱望京寺。
另外，有學者認為，“靖難之役”後建文帝逃亡到了青海瞿曇寺。《創修渭源縣誌》卷九《藝文志》中《五竹寺記》載：“建文於夏六月庚申十三日未時，由癸門出，比時願扈駕二十二人，節(郭節)其一也。君臣奔竄崎嶇，晝伏夜行。歷滇南、巴蜀，建文至樂都瞿曇寺。”據史料記載，瞿曇寺建立初期就與明皇室建立了密切關係。永樂以來，明朝歷代帝王給瞿曇寺賜匾、修佛堂、封國師、賜印、派大臣等史不絕書，這種割捨不斷的關係本身就耐人尋味。“靖難之役”爆發後，燕王率軍南下，北方道路被封，建文帝只有向南方逃竄，輾轉雲貴、巴蜀，最後選擇西北邊荒的河湟地區作為落腳點，是極有可能的。這一逃亡路線正好也印證了民間傳說中的“滇、黔、巴蜀間相傳有帝為僧時往來跡”的說法。
北京西山，老死無名
谷應泰《明史紀事本末》和鄭曉《吾學篇》中，記載建文帝在外遊歷，到正統七年，因年紀已老，就到廣西思恩州官府，自稱是建文帝。當地官員急忙上報朝廷，將其送至京師。朝廷派老宦官吳亮前去辨認。建文帝一見到他就叫出了他的名字，吳亮否認。建文帝又說當年他進膳時，扔一片鵝肉到地上，吳亮像狗一樣趴下去吃掉。吳亮聽後伏地大哭，回去後就上吊死了。建文帝被迎入西內，宮中人都叫他“老佛”，老死於宮中後，葬於西山，不封土不種樹，意即“不封不樹”，是古代對庶人的葬禮。
這種說法雖是傳說，但也有一定的根據。《英宗實錄》載正統五年十一月，有個僧人從雲南到廣西，自稱是建文帝，年九十餘。當地官員將其遣送到京師，大臣們懷疑他是假冒的。經過審問，他承認本名叫楊行祥，河南人，洪武十七年為僧，受到別人的蠱惑才假冒建文帝的。於是英宗將其押入大牢，過了四個月就死在獄中了，同謀的十二名僧人被發配到遼東守邊。
還有學者認為，建文帝曾遁匿於貴州安順平壩縣境內的高峰寺。安順是中原聯繫西南的重要通道，明代先後有幾十萬大軍來此軍屯，他們祖籍大多為南京郊區以及江浦、六合等地。同時此地還有諸多隱匿的有利條件：依山傍水，地形隱蔽，易守難攻，不易發現;語言便於溝通;生活便於適應。據《平壩縣誌》載：高峰寺懸壁處，有“西來面壁”石刻，相傳出自建文帝手筆。“西”可能是“璽”的諧音。玉璽是皇權的象徵，建文帝逃到哪裡，玉璽也會帶到哪裡。高峰寺內齋堂地下有一處藏身洞，洞底有一石碑，上刻銘文：“秀峰肇建文跡塵知空般若門。”另一石碑為萬曆時所刻，碑文說高峰寺建於洪武七年，開山僧為秀峰大師，他於永樂四年七月收留過建文帝。
安順當地崖壁上有塊高大的“紅崖天書”，長十米，高六米，是用奇特的鐵紅色顏料寫成的文字，似篆非篆，無人能識。據報載最近終於有人破譯了“天書”：其成書約在1406年(明永樂四年)，是遜國的建文皇帝頒發的討伐燕王朱棣篡位的《伐燕詔檄》。全文直譯為：“燕反之心，迫朕遜國。叛逆殘忍，金川門破。殺戮屍橫，罄竹難書。大明日月無光，成囚殺之地。須降伏燕魔，作階下囚。丙戌(1406年)。甲天下之鳳凰(御製)。”這與《明史紀事本末》中所載朱允炆的一首詩相印證：“風塵一夕忽南侵，天命潛移四海心。鳳返丹山紅日遠，龍歸滄海碧雲深。紫微有象星還拱，玉漏無聲水自沉。遙想禁城今夜月，六宮猶望翠華臨。”如果譯文準確無誤，就能證實建文皇帝朱允炆確已逃出，並圖謀恢復。
四川也留下了建文帝的足跡，青川華嚴庵曾為建文帝的避難所。華嚴庵位於青川縣青溪鎮以南七公里的蓮花山上，占地面積超過一百畝，東西兩面是草木叢生的山溝，西側山溝內有巨石壘砌的雙層中空明代石牆，留下了石碑、石佛、九五方圓塔、清皇曆書等遺址、遺物。在“廣佛碑”和“華嚴庵重建碑”兩碑文上，兩者所記載的“建文帝於宣德六年到此”，與《明史紀事本末》中“宣德六年文帝由延安到西安入蜀”的記載相吻合。
還有人認為建文帝在四川平昌佛羅寺躲藏過，並病逝於此，葬於寺後山坡上。建文帝之所以選擇佛羅寺，是喜歡這裡偏僻難尋，不容易被發現。因他常常面向京城的方向暗自哭泣，後人就把佛羅寺改稱望京寺。
另外，有學者認為，“靖難之役”後建文帝逃亡到了青海瞿曇寺。《創修渭源縣誌》卷九《藝文志》中《五竹寺記》載：“建文於夏六月庚申十三日未時，由癸門出，比時願扈駕二十二人，節(郭節)其一也。君臣奔竄崎嶇，晝伏夜行。歷滇南、巴蜀，建文至樂都瞿曇寺。”據史料記載，瞿曇寺建立初期就與明皇室建立了密切關係。永樂以來，明朝歷代帝王給瞿曇寺賜匾、修佛堂、封國師、賜印、派大臣等史不絕書，這種割捨不斷的關係本身就耐人尋味。“靖難之役”爆發後，燕王率軍南下，北方道路被封，建文帝只有向南方逃竄，輾轉雲貴、巴蜀，最後選擇西北邊荒的河湟地區作為落腳點，是極有可能的。這一逃亡路線正好也印證了民間傳說中的“滇、黔、巴蜀間相傳有帝為僧時往來跡”的說法。
北京西山，老死無名
谷應泰《明史紀事本末》和鄭曉《吾學篇》中，記載建文帝在外遊歷，到正統七年，因年紀已老，就到廣西思恩州官府，自稱是建文帝。當地官員急忙上報朝廷，將其送至京師。朝廷派老宦官吳亮前去辨認。建文帝一見到他就叫出了他的名字，吳亮否認。建文帝又說當年他進膳時，扔一片鵝肉到地上，吳亮像狗一樣趴下去吃掉。吳亮聽後伏地大哭，回去後就上吊死了。建文帝被迎入西內，宮中人都叫他“老佛”，老死於宮中後，葬於西山，不封土不種樹，意即“不封不樹”，是古代對庶人的葬禮。
這種說法雖是傳說，但也有一定的根據。《英宗實錄》載正統五年十一月，有個僧人從雲南到廣西，自稱是建文帝，年九十餘。當地官員將其遣送到京師，大臣們懷疑他是假冒的。經過審問，他承認本名叫楊行祥，河南人，洪武十七年為僧，受到別人的蠱惑才假冒建文帝的。於是英宗將其押入大牢，過了四個月就死在獄中了，同謀的十二名僧人被發配到遼東守邊。