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有一天，他去石渠閣查閱檔案，經過孔子書櫃，心中一動，便過去打開查看，竟赫然看到孔壁《論語》古簡。忙展開細讀，簡上所用文字確是古字，但內文與硃安世所盜的《論語》完全相同。
他悵然若失，難道是自己猜測有誤?
但隨即生疑：既然如此，呂步舒先前為何要盜走孔壁《論語》?而且還偷改藏書目錄?既然已經盜走，為何又要放回來?
他慢慢捲起那捲竹簡，卻忽然發現穿皮繩的小孔內壁與外面看起來有些不同：竹簡表面古舊污朽、內壁卻很新鮮。湊近細看，發覺這竹簡其實只是看起來像古簡。這種仿古手段司馬遷以前就曾見過，是用煙燻、泥染、土埋等法子，將新簡做出古舊的模樣，但穿繩之孔太細，不好動手腳，所以難免露出破綻。
這孔壁《論語》是假的!
既然這部古簡是假的，那麼硃安世盜的那部也是假的!呂步舒是在借硃安世之力，以假替真，將假孔壁《論語》流布於世上!
一時間，司馬遷驚怒悲憤之極：呂步舒心機如此可怖!硃安世為了救孔驩而盜經，為進宮而淨身毀容，最後連性命都搭上，盜出來的竟是一部假《論語》!
他又猛地想起衛真，這假《論語》是衛真傳給硃安世，他所傳《論語》不是從孔驩口中得來，而是受呂步舒之命!呂步舒讓衛真給孔驩送飯，只不過是設下釣鉤，用來誘騙蒙蔽我和硃安世。
衛真啊衛真，你為何要這麼做?
司馬遷心中悲傷，不敢深想，匆匆離開了石渠閣。
回到家中，他將此事告訴了柳夫人，柳夫人聽後也驚駭無比，不禁落淚。
史記只剩最後一篇——《孔子列傳》。
這幾年，司馬遷一直在等待孔壁《論語》，然而現在孔驩不知去向，恐怕早已遇害，此生再也無望見到《論語》真文。
他滿腔悲憤，心想：後世縱使不知《論語》真面目，但必須知道這一真相。
於是他奮筆疾書，將真相全部書之於文，終於完成《孔子列傳》。
寫罷最後一個字，天色微亮，已是清晨。他擱下筆，吹滅燈，直起身子，望著案上竹簡，萬千滋味一起湧上心頭，一時間難辨悲喜。不由得喃喃念起兒寬帛書上的那六句：星辰下，書卷空
高陵上，文學燔
九河枯，日華熄
九江涌，天地黯
鼎淮間，師道亡
啼嬰處，文脈懸
尤其是讀到“啼嬰處，文脈懸”，更是喟嘆不已，呆坐半晌，萬千感慨最終化做一聲深嘆，消散於清寒之中。
正要起身，遠處忽然傳來一聲雞鳴，他心中一動：人心郁暗，世道昏亂，孔子一片仁心，不正是這世間的一聲雞鳴?雄雞不會因世人昏睡，便不鳴叫。仁人志士，又何嘗會因為天下無道，便杜口噤聲?孔子一生寂寞，但為傳揚仁義，明知其不可為，卻不遺餘力而為之。
痴嗎?傻嗎?的確是。
但世間若沒有了這一點痴傻，人心還能剩下什麼?
人可死，魂不可滅。他精神一振，生出一念，忙抓起書刀[書刀：又稱“削”，書寫修改工具。秦漢時期文字書寫於竹簡，有誤則用刀削去重寫。]，將卷首《孔子列傳》的“列傳”二字削刮去，重新提筆蘸墨，寫下“世家”二字。
他寫史記，是以人為綱，獨創了紀傳體，將史上人物按身份分為“本紀”、“世家”、“列傳”三類。《本紀》記帝王，《世家》記王侯，《列傳》則記載古今名臣名士、特出人物。孔子家世低微，故而一直分在《列傳》中。但此刻想來，孔子雖不是王侯，但孔子之重，重過歷代所有王侯。世間少一位王侯，並無損失，但世間若沒有了仁義，則暗無天日。
史記完成，只剩下最後一件事：如何留傳?
古史部分倒還好，天子也曾看過。但當代之史，不少都是隱秘醜聞，尤其景帝及當今天子本紀，他毫無避諱，秉筆直書，一旦被天子看到，必會被焚毀。
他能託付的人，只有女兒女婿，女兒司馬英頗具膽識，自不會推脫，但女婿楊敞膽小怕事，只要看到當今天子本紀，就斷然不敢收留史記。就算他敢，一旦被察覺，也必將禍及全族。孔壁《論語》之禍已經令人慘痛，再不能為了史記，又禍害親人、傷及無辜。但如果不能公諸於世，寫史記又有何用?
司馬遷思前想後，始終想不出一個妥善之策。
幸好柳夫人想到一個主意：抄一份副本，將該避諱的地方全部刪去，再交給女兒女婿，這樣，至少大部分史記能得以留傳。至於正本，萬萬不能托人收藏，找個隱秘的地方，埋藏起來，以待後世之人發掘。
這個法子兩全其美，很是妥當。但正本藏在哪裡好?
藏的地方既不能太顯著，也不能太荒僻。太顯著，易被當世人發現，則仍然難逃被毀之運;太荒僻，則恐怕永世都不會被人發現。最好是劉氏王朝覆滅之後，再被發現，到那時，則不用再怕觸怒朝廷。但什麼地方能保證這一點?
夫妻兩個一邊思索商議，司馬遷一邊抓緊抄寫史記副本，邊抄邊刪改：景帝及當今天子本紀，全部刪去[世傳《史記》有缺失，班固言“十篇有錄無書”(《漢書·藝文志》)。其中包括《孝景本紀》和《孝武本紀》。唐人司馬貞《史記索隱》指出：“《景紀》取班書補之，《武紀》專取《封禪書》”，其中《孝景本紀》是從《漢書》摘補，《武帝本紀》由《史記·封禪書》中截取。];河間獻王劉德，只留下劉德好儒學一句，藏書、獻書及死因全部刪去[世傳《史記》關於河間獻王劉德只有簡略一句：“好儒學，被服造次必於儒者。山東諸儒多從之游。”(《史記·五宗世家》)];淮南王劉安，有意記得極其詳細，文中處處自相矛盾[參見《史記·淮南衡山列傳》。];遊俠列傳中，硃安世段落本來篇幅最多，只有狠下心，全部刪除。趙王孫、樊仲子、郭公仲只錄其名，事跡全都刪去[參見《史記·遊俠列傳》];孔子第十一代孫中，孔延年為嫡長子，刪去其子孫名姓，以為諷戒[《史記·孔子世家》中第十一代孫，記錄次子孔安國子孫姓名，卻未記錄嫡長子孔延年子孫姓名。];孔安國、孔驩經歷全部刪除，只留下一句“安國生卬，卬生驩[參見《史記·孔子世家》]”;想到孔壁《論語》就此湮滅，他心中實在不甘，再三思忖，又提筆在孔安國處添了一句“至臨淮太守，早卒”。孔安國死時已年過六旬，用“早卒”二字，暗示他死於非命[孔安國生卒年為歷史懸案，至今未解。司馬遷《史記·孔子世家》中記載孔安國“早卒”，然而《孔子家語後序》與《孔子世家譜》則稱孔安國“年六十卒”。而且孔安國既已有孫，當不算“早卒”。];至於孔壁《論語》，只在《仲尼弟子列傳》篇末提及“孔氏古文”，寫了一句：“論言弟子籍，出孔氏古文近是。余以弟子名姓文字悉取論語弟子問並次為篇，疑者闕焉。[見《史記·仲尼弟子列傳》大意為：講述孔子弟子的書籍，孔家所傳古文經最接近真實，我摘取《論語·弟子問》中語句依次編寫成篇，可疑之處，只能空缺。]”
他悵然若失，難道是自己猜測有誤?
但隨即生疑：既然如此，呂步舒先前為何要盜走孔壁《論語》?而且還偷改藏書目錄?既然已經盜走，為何又要放回來?
他慢慢捲起那捲竹簡，卻忽然發現穿皮繩的小孔內壁與外面看起來有些不同：竹簡表面古舊污朽、內壁卻很新鮮。湊近細看，發覺這竹簡其實只是看起來像古簡。這種仿古手段司馬遷以前就曾見過，是用煙燻、泥染、土埋等法子，將新簡做出古舊的模樣，但穿繩之孔太細，不好動手腳，所以難免露出破綻。
這孔壁《論語》是假的!
既然這部古簡是假的，那麼硃安世盜的那部也是假的!呂步舒是在借硃安世之力，以假替真，將假孔壁《論語》流布於世上!
一時間，司馬遷驚怒悲憤之極：呂步舒心機如此可怖!硃安世為了救孔驩而盜經，為進宮而淨身毀容，最後連性命都搭上，盜出來的竟是一部假《論語》!
他又猛地想起衛真，這假《論語》是衛真傳給硃安世，他所傳《論語》不是從孔驩口中得來，而是受呂步舒之命!呂步舒讓衛真給孔驩送飯，只不過是設下釣鉤，用來誘騙蒙蔽我和硃安世。
衛真啊衛真，你為何要這麼做?
司馬遷心中悲傷，不敢深想，匆匆離開了石渠閣。
回到家中，他將此事告訴了柳夫人，柳夫人聽後也驚駭無比，不禁落淚。
史記只剩最後一篇——《孔子列傳》。
這幾年，司馬遷一直在等待孔壁《論語》，然而現在孔驩不知去向，恐怕早已遇害，此生再也無望見到《論語》真文。
他滿腔悲憤，心想：後世縱使不知《論語》真面目，但必須知道這一真相。
於是他奮筆疾書，將真相全部書之於文，終於完成《孔子列傳》。
寫罷最後一個字，天色微亮，已是清晨。他擱下筆，吹滅燈，直起身子，望著案上竹簡，萬千滋味一起湧上心頭，一時間難辨悲喜。不由得喃喃念起兒寬帛書上的那六句：星辰下，書卷空
高陵上，文學燔
九河枯，日華熄
九江涌，天地黯
鼎淮間，師道亡
啼嬰處，文脈懸
尤其是讀到“啼嬰處，文脈懸”，更是喟嘆不已，呆坐半晌，萬千感慨最終化做一聲深嘆，消散於清寒之中。
正要起身，遠處忽然傳來一聲雞鳴，他心中一動：人心郁暗，世道昏亂，孔子一片仁心，不正是這世間的一聲雞鳴?雄雞不會因世人昏睡，便不鳴叫。仁人志士，又何嘗會因為天下無道，便杜口噤聲?孔子一生寂寞，但為傳揚仁義，明知其不可為，卻不遺餘力而為之。
痴嗎?傻嗎?的確是。
但世間若沒有了這一點痴傻，人心還能剩下什麼?
人可死，魂不可滅。他精神一振，生出一念，忙抓起書刀[書刀：又稱“削”，書寫修改工具。秦漢時期文字書寫於竹簡，有誤則用刀削去重寫。]，將卷首《孔子列傳》的“列傳”二字削刮去，重新提筆蘸墨，寫下“世家”二字。
他寫史記，是以人為綱，獨創了紀傳體，將史上人物按身份分為“本紀”、“世家”、“列傳”三類。《本紀》記帝王，《世家》記王侯，《列傳》則記載古今名臣名士、特出人物。孔子家世低微，故而一直分在《列傳》中。但此刻想來，孔子雖不是王侯，但孔子之重，重過歷代所有王侯。世間少一位王侯，並無損失，但世間若沒有了仁義，則暗無天日。
史記完成，只剩下最後一件事：如何留傳?
古史部分倒還好，天子也曾看過。但當代之史，不少都是隱秘醜聞，尤其景帝及當今天子本紀，他毫無避諱，秉筆直書，一旦被天子看到，必會被焚毀。
他能託付的人，只有女兒女婿，女兒司馬英頗具膽識，自不會推脫，但女婿楊敞膽小怕事，只要看到當今天子本紀，就斷然不敢收留史記。就算他敢，一旦被察覺，也必將禍及全族。孔壁《論語》之禍已經令人慘痛，再不能為了史記，又禍害親人、傷及無辜。但如果不能公諸於世，寫史記又有何用?
司馬遷思前想後，始終想不出一個妥善之策。
幸好柳夫人想到一個主意：抄一份副本，將該避諱的地方全部刪去，再交給女兒女婿，這樣，至少大部分史記能得以留傳。至於正本，萬萬不能托人收藏，找個隱秘的地方，埋藏起來，以待後世之人發掘。
這個法子兩全其美，很是妥當。但正本藏在哪裡好?
藏的地方既不能太顯著，也不能太荒僻。太顯著，易被當世人發現，則仍然難逃被毀之運;太荒僻，則恐怕永世都不會被人發現。最好是劉氏王朝覆滅之後，再被發現，到那時，則不用再怕觸怒朝廷。但什麼地方能保證這一點?
夫妻兩個一邊思索商議，司馬遷一邊抓緊抄寫史記副本，邊抄邊刪改：景帝及當今天子本紀，全部刪去[世傳《史記》有缺失，班固言“十篇有錄無書”(《漢書·藝文志》)。其中包括《孝景本紀》和《孝武本紀》。唐人司馬貞《史記索隱》指出：“《景紀》取班書補之，《武紀》專取《封禪書》”，其中《孝景本紀》是從《漢書》摘補，《武帝本紀》由《史記·封禪書》中截取。];河間獻王劉德，只留下劉德好儒學一句，藏書、獻書及死因全部刪去[世傳《史記》關於河間獻王劉德只有簡略一句：“好儒學，被服造次必於儒者。山東諸儒多從之游。”(《史記·五宗世家》)];淮南王劉安，有意記得極其詳細，文中處處自相矛盾[參見《史記·淮南衡山列傳》。];遊俠列傳中，硃安世段落本來篇幅最多，只有狠下心，全部刪除。趙王孫、樊仲子、郭公仲只錄其名，事跡全都刪去[參見《史記·遊俠列傳》];孔子第十一代孫中，孔延年為嫡長子，刪去其子孫名姓，以為諷戒[《史記·孔子世家》中第十一代孫，記錄次子孔安國子孫姓名，卻未記錄嫡長子孔延年子孫姓名。];孔安國、孔驩經歷全部刪除，只留下一句“安國生卬，卬生驩[參見《史記·孔子世家》]”;想到孔壁《論語》就此湮滅，他心中實在不甘，再三思忖，又提筆在孔安國處添了一句“至臨淮太守，早卒”。孔安國死時已年過六旬，用“早卒”二字，暗示他死於非命[孔安國生卒年為歷史懸案，至今未解。司馬遷《史記·孔子世家》中記載孔安國“早卒”，然而《孔子家語後序》與《孔子世家譜》則稱孔安國“年六十卒”。而且孔安國既已有孫，當不算“早卒”。];至於孔壁《論語》，只在《仲尼弟子列傳》篇末提及“孔氏古文”，寫了一句：“論言弟子籍，出孔氏古文近是。余以弟子名姓文字悉取論語弟子問並次為篇，疑者闕焉。[見《史記·仲尼弟子列傳》大意為：講述孔子弟子的書籍，孔家所傳古文經最接近真實，我摘取《論語·弟子問》中語句依次編寫成篇，可疑之處，只能空缺。]”