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緊接著，前任日本關東軍總司令本庄繁大將、日軍炮兵部隊總司令木村兵太郎大將、日軍原關東軍首腦土肥原賢二大將和石原莞爾中將、外務大臣廣田鴻毅、陸軍大臣武藤章大將、日本駐華外交官松岡洋右、日本海軍大將永野修身、日本海軍聯合艦隊總司令山本五十六大將、前任日本駐朝鮮派遣軍總司令林銑十郎大將、前日本華東派遣軍總參謀長橫山勇大將、前首相近衛文磨等等等五百多名東北邊防都列出的“黑名單”上的日本戰犯魁首統統被東北軍的憲兵部隊給抓捕。整個抓捕行動迅速擴展到了整個日本，一時間，日本列島上到處晃動著東北軍憲兵部隊的身影，全國腥風血雨。
第303步兵師的一支先遣支隊在王宏民中尉的帶領下直接闖入了日本皇宮中。在後宮，王中尉見到了日本最高統領者——日本裕仁天皇。王中尉地面色慘白的裕仁天皇冷冷道：“裕仁先生，你因涉嫌犯下破壞和平罪、戰爭罪、反人類罪而被逮捕了！”
血火中的東京開始迴蕩起了孤魂野鬼的鬼哭狼嚎聲，震驚世界的東京大屠殺開始了。
埃卡特-奧特爾，德國國防軍陸軍中校，他在他的回憶錄《黑色的東京》中這樣描述了當時他在日本東京的見聞：
“六年前的1937年，我作為中國國民革命軍的德國顧問曾參加了修建拱衛中國國都南京的‘鐵山’防線的工程設計，後來我又留在了南京協助中國軍隊抵抗進攻過來的日本帝國軍隊，當時我還有幸結識了中國東北軍的著名將領，龍雲峰上將，當時他的軍銜還是少將，職務是南京城防司令部總參謀長。在南京保衛戰的後期，我親眼目睹了日本軍隊在南京城內無惡不作、燒殺姦淫搶掠等種種喪心病狂、令人髮指的罪行，無數手無寸鐵的中國平民和已經放下武器投降的中國士兵被日本軍隊用異常殘酷的手段給處決屠殺，這些不管是不是有預謀的，都絕對是人類最嚴重的犯罪行為。整個南京屍積如山、血流戚河，日本人完全就是以殺人作為消遣和娛樂，在他們眼裡，中國人的性命和豬狗一樣不值錢，南京內外漫山遍野都是死屍，那真是中國人最噩夢的一段煉獄時期，毫不誇張地說，那段時間內，中國人的鮮血已經把南京的古城牆給塗紅了，而中國人的屍骨也幾乎要把長江給填滿斷流了。日本軍隊就是一群披著人皮的野獸！這支軍隊的存在簡直就是世界的恥辱！但是時過境迂，如今，這一幕幕大屠殺的慘劇又發生了，但是屠殺者和被屠殺者的身份已經顛倒了過來，而且被屠城的從中國的國都南京變成了日本的國都東京，中國人開始瘋狂地屠殺起了日本人，他們確實有資格這麼做。進入東京的中國東北軍毫不含糊、毫不心慈手軟地執行著龍雲峰上將‘以牙還牙、以血還血’的報複方針，中國東北軍的屠殺手段比起日軍更加殘暴，更加血腥恐怖，東京大屠殺的規模也遠遠超過了南京大屠殺。但我對那些被屠殺的日本人一點也不感到同情，他們這是咎由自取，是自食惡果，因為我知道，中國人和中華民族並不是一個嗜血嗜殺的殘忍民族，他們和我們德國結盟一直非常地友好和善良，他們的歷史也說明他們一直是個苦難的民族，而讓他們變得如此殘暴的原因，則還在日本人自身的身上，因為在這個世界上活下去唯有以暴制暴、以殺止殺。因為對付像野獸一樣窮凶極惡且志恩負義的日本人，唯有使用對付野獸的辦法！那就是殺！人道主義此時是極其的可笑和微不足道的，我們又有什麼資格指責此時殺紅眼的中國人？誰能阻擋一支正在復仇的軍隊的屠殺行為？投有！上帝都不能！”
東京灣成了東北軍拋屍毀跡的最大的場所，從6月2日起，裝滿日本人死屍的汽車側川流不息地往返於市區和港灣碼頭，往海里傾倒了成千上萬噸的屍骸。曾在東京灣邊參加毀屍滅跡行動的東北軍第299師第911“骷髏團”的一名叫陳星橋的少校後來和別人敘述道；
“6月3日那一天，團長鍾育煊上校給我下達了一個命令，他說一營正在東京灣北部的美濱區進行‘處理工作’，讓我率領二營在東京灣西部的浦安區參加‘處理工作’，因為工作量實在是太龐大，各個部隊都感到人手不夠。我在浦安區帶著二營動用了30艘汽艇、170輛汽車，碼頭邊日本人的死屍堆積如山，僅僅三天的時間內，經我處理的屍體就多達20000具，另外師部還在江戶川區處理了超過10萬具的屍體，其中有4萬多具是被掩埋和焚燒的，其餘的全部被扔
進了東京灣；友軍的部隊在我們附近的那六個城區起碼處理了15萬日本人。後來我經過浦安區旁邊的江東區，仍然可以看見第263機械化步兵師在師長吳俊壘少將的指揮下用機槍集體掃射著日本人，很多日本人倒在死人堆呈的還沒有死透，還在喘氣或掙扎著，監視的263師的弟兄們便上前挨個補刺刀。經過我處理的屍體也還有不少投有死絕，便我命令士兵們用裝貨的鐵鉤子將他們全部打死，那慘叫聲十分瘮人。5日那一天，大量逃命的日本人從城區逃到了海邊，密密麻麻蜂擁擠在一起，游弋在海岸邊的‘華東’號戰列艦在艦長劉峰嶺的命令下，用410毫米的巨口徑艦炮和155毫米的副艦炮對著人群進行多發轟射，頃刻間碼頭上血肉橫飛、屍骸人頭亂滾，大批的日本人被炸得稀爛，慘叫聲和哀嚎聲震天轟鳴，肉醬碎末漫天飛舞，像下了一場‘肉雨’。”
第303步兵師的一支先遣支隊在王宏民中尉的帶領下直接闖入了日本皇宮中。在後宮，王中尉見到了日本最高統領者——日本裕仁天皇。王中尉地面色慘白的裕仁天皇冷冷道：“裕仁先生，你因涉嫌犯下破壞和平罪、戰爭罪、反人類罪而被逮捕了！”
血火中的東京開始迴蕩起了孤魂野鬼的鬼哭狼嚎聲，震驚世界的東京大屠殺開始了。
埃卡特-奧特爾，德國國防軍陸軍中校，他在他的回憶錄《黑色的東京》中這樣描述了當時他在日本東京的見聞：
“六年前的1937年，我作為中國國民革命軍的德國顧問曾參加了修建拱衛中國國都南京的‘鐵山’防線的工程設計，後來我又留在了南京協助中國軍隊抵抗進攻過來的日本帝國軍隊，當時我還有幸結識了中國東北軍的著名將領，龍雲峰上將，當時他的軍銜還是少將，職務是南京城防司令部總參謀長。在南京保衛戰的後期，我親眼目睹了日本軍隊在南京城內無惡不作、燒殺姦淫搶掠等種種喪心病狂、令人髮指的罪行，無數手無寸鐵的中國平民和已經放下武器投降的中國士兵被日本軍隊用異常殘酷的手段給處決屠殺，這些不管是不是有預謀的，都絕對是人類最嚴重的犯罪行為。整個南京屍積如山、血流戚河，日本人完全就是以殺人作為消遣和娛樂，在他們眼裡，中國人的性命和豬狗一樣不值錢，南京內外漫山遍野都是死屍，那真是中國人最噩夢的一段煉獄時期，毫不誇張地說，那段時間內，中國人的鮮血已經把南京的古城牆給塗紅了，而中國人的屍骨也幾乎要把長江給填滿斷流了。日本軍隊就是一群披著人皮的野獸！這支軍隊的存在簡直就是世界的恥辱！但是時過境迂，如今，這一幕幕大屠殺的慘劇又發生了，但是屠殺者和被屠殺者的身份已經顛倒了過來，而且被屠城的從中國的國都南京變成了日本的國都東京，中國人開始瘋狂地屠殺起了日本人，他們確實有資格這麼做。進入東京的中國東北軍毫不含糊、毫不心慈手軟地執行著龍雲峰上將‘以牙還牙、以血還血’的報複方針，中國東北軍的屠殺手段比起日軍更加殘暴，更加血腥恐怖，東京大屠殺的規模也遠遠超過了南京大屠殺。但我對那些被屠殺的日本人一點也不感到同情，他們這是咎由自取，是自食惡果，因為我知道，中國人和中華民族並不是一個嗜血嗜殺的殘忍民族，他們和我們德國結盟一直非常地友好和善良，他們的歷史也說明他們一直是個苦難的民族，而讓他們變得如此殘暴的原因，則還在日本人自身的身上，因為在這個世界上活下去唯有以暴制暴、以殺止殺。因為對付像野獸一樣窮凶極惡且志恩負義的日本人，唯有使用對付野獸的辦法！那就是殺！人道主義此時是極其的可笑和微不足道的，我們又有什麼資格指責此時殺紅眼的中國人？誰能阻擋一支正在復仇的軍隊的屠殺行為？投有！上帝都不能！”
東京灣成了東北軍拋屍毀跡的最大的場所，從6月2日起，裝滿日本人死屍的汽車側川流不息地往返於市區和港灣碼頭，往海里傾倒了成千上萬噸的屍骸。曾在東京灣邊參加毀屍滅跡行動的東北軍第299師第911“骷髏團”的一名叫陳星橋的少校後來和別人敘述道；
“6月3日那一天，團長鍾育煊上校給我下達了一個命令，他說一營正在東京灣北部的美濱區進行‘處理工作’，讓我率領二營在東京灣西部的浦安區參加‘處理工作’，因為工作量實在是太龐大，各個部隊都感到人手不夠。我在浦安區帶著二營動用了30艘汽艇、170輛汽車，碼頭邊日本人的死屍堆積如山，僅僅三天的時間內，經我處理的屍體就多達20000具，另外師部還在江戶川區處理了超過10萬具的屍體，其中有4萬多具是被掩埋和焚燒的，其餘的全部被扔
進了東京灣；友軍的部隊在我們附近的那六個城區起碼處理了15萬日本人。後來我經過浦安區旁邊的江東區，仍然可以看見第263機械化步兵師在師長吳俊壘少將的指揮下用機槍集體掃射著日本人，很多日本人倒在死人堆呈的還沒有死透，還在喘氣或掙扎著，監視的263師的弟兄們便上前挨個補刺刀。經過我處理的屍體也還有不少投有死絕，便我命令士兵們用裝貨的鐵鉤子將他們全部打死，那慘叫聲十分瘮人。5日那一天，大量逃命的日本人從城區逃到了海邊，密密麻麻蜂擁擠在一起，游弋在海岸邊的‘華東’號戰列艦在艦長劉峰嶺的命令下，用410毫米的巨口徑艦炮和155毫米的副艦炮對著人群進行多發轟射，頃刻間碼頭上血肉橫飛、屍骸人頭亂滾，大批的日本人被炸得稀爛，慘叫聲和哀嚎聲震天轟鳴，肉醬碎末漫天飛舞，像下了一場‘肉雨’。”