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但第５個攻擊波登陸時，受到日軍殘存的飛彈、火炮、迫擊炮和自動武器從突擊隊員控制著的空降陣地下面的峭壁洞穴里猛烈射擊。有的艦艇在前進中被擊中。
登陸突擊隊的指揮官孫有亮乘坐的登陸艦在駛往馬林塔山腳下的黑色海灘的途中，就被日軍的機槍火力擊中４０處。１輛２０１０式主戰坦克從海灘向日軍陣地攻擊時也中雷被毀，還有１輛自行火炮和１門防空炮彈合一系統也相繼碰上地雷，造成了支援車輛在登陸時的小小混亂。但登陸部隊很快就通過布雷場和鐵絲網並發起衝擊。第六師混編旅只以很小的代價，就向島內推進幾百米，爾後又向東發展進攻，於凌晨３點占領了該島腰部的高地馬林塔山。
機降第４梯隊也於凌晨３點到達，頂部台地上空再次布滿了直升機。這些突擊隊員著陸後，除以一部兵力防守空降場外，其餘立即奪取了南船塢以北４５０米處的日軍防空陣地，控制了由南船塢到山頂的公路，以保障與登陸部隊會合。經過短暫休整的前三梯隊除以１部繼續與防守在莫里森山和絕壁邊緣的日軍作戰外，主力分別向切尼山谷和拉姆齊山谷出擊。
日出時，賀學甫和孫有亮在島上的兵力約有５０００人，雖然對面日軍也有５０００多人，但解放軍已占據了兩個高地，即山頂台地和馬林塔山，並得到自己的坦克、榴彈炮和海軍的艦炮以及海軍航空隊的戰鬥機的支援。日軍則被分割包圍，缺少指揮和通信聯絡，雖然不時有日軍不知天高地厚地從洞穴出來與解放軍老兵進行白刃戰，但也無法奪回主動權。
隨著夜晚的降臨，固守在坑道和岩洞內的日軍被解放軍火焰噴射器搞得絕望，堅守馬林塔山隧道里的日軍首先點燃了隧道內貯存的數十噸彈藥自殺，金德里機場南部的猴頭小岬上的一個貯藏彈藥的岩洞也被自毀了。其它岩洞內的日軍則忘了武士道精神，紛紛舉起雙手走了出來。６月１２日清晨，除了解放軍在島上追捕日軍零星的狙擊手外，整個科雷希多島已平靜下來。在這次戰鬥中，“旋風部隊”傷亡２００多人，打死打傷日軍５５００餘人，生俘２４００餘人。
６月１２日，惱羞成怒的小野正組織力量準備奪回近在咫尺的科雷希多島，突然驚聞南邊２２０多公里的民都洛島，解放軍開始大規模登陸。恍然大悟的小野急忙取消對科雷希多島的反擊，把預備隊派往民都洛島戰場。由於不能使用馬尼拉的港口，運兵效率大大下降。對科雷希多島如梗在喉的小野命令岸基反艦飛彈部隊和潛艇部隊對不遠處的解放軍兩洋艦隊展開飽和攻擊。
駐菲日本空軍首先起飛了一些無人偵察飛機，雖然有不少被擊落，但還是弄清楚了中國艦隊的具體位置。潛艇部隊按照偵察機提供的參數，在距中國艦隊２００到３００海里處，發射了１００多反艦型巡航飛彈；洞穴中的岸基飛彈部隊也發射了６０多枚衝壓式超音速反艦飛彈，在海平面３０米左右以３倍音速掠過，強勁的尾流激起海水陣陣不安的波紋。
對解放軍艦隊防空能力的考驗開始了。
艦載機的火力攔截幾乎無效，倒是ＥＪ─１０Ａ電子戰飛機的微波武器發揮威力，摧毀了２０幾枚巡航飛彈。一共有１４０多枚反艦飛彈進入艦隊“天空哨兵”相控陣雷達系統的防區，雖然飛彈群還沒在艦載雷達視野里出現，高效率的“天空哨兵”系統邊開始運轉。空中的ＹＪ─８Ｂ中型預警機利用強有力的下視能力偵測飛彈，並將情報從空中傳回作為各戰鬥群防空指揮中心的“北京”級巡洋艦的作戰室，然後具體分到各“旅洋”級驅逐艦和“泰山”級武庫艦。
此時，在艦隊指揮室里的邢凱山緊張得手心出汗，所有的艦長和水兵也很緊張，這畢竟是他們第一次面對如此大規模的飛彈攻擊。兩洋艦隊的“泰山”級武庫艦、“北京”級巡洋艦和“旅洋”級驅逐艦開始發射空氣燃料炮彈，它們和航空母艦的ＣＳＡ─Ｎ─４艦空飛彈垂直發射裝置也都打開了隨時準備發射。
幾道空氣燃料阻擊圈發揮了作業，又有５０枚飛彈被撕碎。“天空哨兵”系統能同時跟蹤十來批共５００個空中目標並指揮ＳＡ─Ｎ─４艦空飛彈對其中２０個進行打擊。這次參加攔截的一共有４０幾艘軍艦的上千枚ＳＡ─Ｎ─４，如此密集的火力，應該可以攔截住所有來襲飛彈。
衝壓式超音速反艦飛彈以超過１０００米／秒的速度飛行，快過自動步槍子彈的初速。從空中看去，就象一隻只貼著浪尖飛翔的邪惡海鷗。“北京”級巡洋艦的“天空哨兵”相控陣雷達系統最先掃描到撲面而來的飛彈群，ＳＡ─Ｎ─４井蓋就立即打開，解放軍的水兵是訓練有素的，目標識別，分配火力，跟蹤，鎖定，開火，幾乎在瞬間完成了上述程序。細長的ＳＡ─Ｎ─４對空飛彈從發射井中躍出，巨大的桔紅色尾流通過倒流通道反衝出甲板。第二枚，第三枚，……這４０幾艘軍艦每艘都以１枚／秒的速率，拼命地發射飛彈，整個艦隊就象是在放焰火，尉為壯觀。
幾秒鐘後，助推器脫落，約５００枚ＳＡ─Ｎ─４重新俯衝，重入低空，在目標照射雷達的指引下尋找著飛來的目標再打開自身的扇形搜索火控雷達。這個“彈雨戰術”保證每枚來襲的飛彈都有三枚以上ＳＡ─Ｎ─４“盯哨”。兩群飛彈的距離在不斷縮短。巡航飛彈和衝壓式反艦飛彈紛紛啟動了自動規避程序，飛彈在低空做蛇形機動，不規則地變換航向。ＳＡ─Ｎ─４也不斷根據目標的動作修正航向。以７倍以上速度相遇的兩枚飛彈，攔截成功與否，就在那一剎那。一枚ＳＡ─Ｎ─４準確地直接撞上了巡航飛彈，兩彈在海面立刻爆成一團絢爛的火球。在遼闊的海面上，到處是這樣的火球。僅僅幾秒鐘，一切都結束了，無論是成功命中還是脫靶，無論是被攔擊還是順利突防，攔截大戰已經結束了。突破防線的２０枚飛彈已經遠去。